Orthopoxvirus, osoitus
| 15392 | -PoxPAK |
Osatutkimukset
-PoxNhO, -PoxVi ja -VirEm
Tiedustelut
Virologian ja immunologian laboratorio, Virologian ja immunologian erikoistutkimukset, p.050 427 2164
Yhteyshenkilöt
sairaalamikrobiologi Hannimari Kallio-Kokko: hannimari.kallio-kokko
hus.fi / 050 427 0476, lääkäri Olli Vapalahti: olli.vapalahtihelsinki.fi / 040 838 4015 ja sairaalamikrobiologi Annemarjut Jääskeläinen: annemarjut.jaaskelainenhus.fi / 0504288017
Lähete
Indikaatiot
Kliininen epäily orthopoxvirusinfektiosta (lähinnä lehmärokko). Infektiohälytystilanteet (isorokkoepäily tai apinarokkoepäily). Parapoxvirusinfektiota epäiltäessä (esim. Orf-virusten aiheuttama infektio ihmisellä) myös pyyntö -ZoonNhO, 20857.
Näyteastia
Katso kohta "Näyte" (Weblab Clinicalissa "Näytteen käs.ohjeet")
Näyte
Rikotun rakkulan pohjalta tai leesiosta otetaan näyte steriilillä dacron- tai nailontikulla viruskuljetusputkeen tai vaihtoehtoisesti tehdaspuhtaaseen, kierrekorkilliseen muoviputkeen, jossa n. 1 ml steriiliä keittosuolaliuosta. Kudospala (muutaman mm3:n pala) laitetaan kierrekorkilliseen muoviputkeen pieneen määrään steriiliä fysiologista keittosuolaliuosta tai viruskuljetusputkeen. Kudospalan voi toimittaa myös steriiliin fysiologiseen keittosuolaan kostutetussa sideharsotaitoksessa, joka on suljettu tehdaspuhtaaseen kierrekorkilliseen muoviseen näyteastiaan.
Menetelmä
Tutkimuspaketti. Nukleiinihapon osoitus PCR-tekniikalla. Virusviljely. Elektronimikroskopia (EM). Orthopoxvirusten tai parapoxvirusten tyypitys tehdään sekvenoinnin avulla. Laboratorio valitsee kulloinkin diagnoosiin tarvittavat menetelmät, ensisijaisesti tehdään vain nukleiinihapon osoitus.
Tekotiheys
Tarpeen mukaan
Tulokset valmiina
Alustava tulos elektronimikroskopiasta 1-2 työpäivän aikana; viljelystä ja PCR:stä 3-5 työpäivän aikana; tarkempi tyypitys 1-2 viikon kuluessa näytteen saapumisesta.
Tulkinta
Poxvirus-DNA:n löytyminen näytteestä suoraan tai virusviljelyn jälkeen on diagnostinen löydös.
Huomautuksia
Lisäksi suositellaan samanaikaista seeruminäytettä, josta tehdään orthopoxvirus IgM- ja IgG-vasta-ainemääritykset, ks. S-Orthopoxvirus, vasta-aineet (pyyntö S-PoxAb, KL 4609).
Parapoxvirusinfektiota (esim. Orf-virus) epäiltäessä tilataan -POXPAK-tutkimuksen lisäksi myös -ZoonNhO-tutkimus (20857), tätä tutkimusta tilattaessa on otettava ennakkoon yhteys tutkivaan laboratorioon.
Huom. Myös infektiohälytystilanteessa (isorokko- tai apinarokkoepäilyssä) on aina jo ennen näytteenottoa otettava yhteys tutkivaan laboratorioon!
Tutkimus -PoxPAK päivitetty 08.01.2020 / HKK
Viimeisin päivitys: 24.10.2021 klo 02:27.