HUSLAB

Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan

Bakteeri, viljely ja nukleiinihappo (kval), ulosteesta, ulosteesta

21088 F -BaktVIP

Tiedustelut

Bakteriologian laboratorio, puh. (09) 471 73082 tai 471 73040

Yhteyshenkilöt

mikrobiologi Jenni Antikainen: jenni.antikainenathus.fi / 050 452 6712

Indikaatiot

Bakteeriperäiseksi epäillyn ripulitaudin (erityisesti turistiripulin) etiologian selvittely.

Tutkimukseen kuuluu ulostepatogeenien osoitus nukleiinihaponosoituksella sekä positiivisten löydösten osoittaminen viljelymenetelmällä.

Tutkimus sisältää F-BaktVi1 ja F-EHECVTx-tutkimukset, eikä niitä tarvitse tilata erikseen. Tällä tutkimuksella voidaan osoittaa Salmonella, Shigella, Campylobacter, Yersinia enterocolitica/pseudotuberculosis, sekä ns. ripuli-E.coli -kannat (Enterohemorraginen E. coli EHEC, Enteroaggregatiivinen E. coli EAEC, Enteroinvasiivinen E. coli EIEC, Enterotoksigeeninen E. coli ETEC, Enteropatogeeninen E. coli EPEC).

Näistä EAEC-, EIEC-, EPEC- ja ETEC-kannat voidaan osoittaa ainoastaan nukleiinihaponosoituksella, eikä niistä tehdä viljelyä/herkkyysmääritystä. Muiden lajien osalta tehdään viljely PCR-positiivisesta näytteestä, ja löydös nimetään tarkemmin sekä määritetään mikrobilääkeherkkyys. EHEC ja Vibrio cholerae löydöksille ei määritetä herkkyyttä.

Huom. 26.11.2019 alkaen tutkimus ei sisällä Vibrio choleraeta, vaan se on tarvittaessa tilattava erikseen (F -VichVi 2094)

Harvinaisten, turistiripulia mahdollisesti aiheuttavan aeromonaksen ja ripulia mahdollisesti aiheuttavan plesiomonaksen toteamiseen on erilliset tutkimukset: Aeromonas, viljely ulosteesta, 4374 F -AeroVi ja Plesiomonas shigelloides, viljely ulosteesta, 3997 F -PlesVi.

Näyteastia

Copan eNAT ja geelikuljetusputki

Näyte

Reilu määrä tuoretta ulostetta, erityisesti sen pinnalla mahdollisesti esiintyvää verilimaa, dacrontikulla yhteen eNAT-putkeen ja yhteen geelikuljetusputkeen (Transpocult tai vastaava). Näytekuljetusputki ei saa sisältää hiiltä. Putket muovipussiin. Kts. näytteenotto-ohjeet (https://huslab.fi/ohjekirjan_liitteet/potilasohjeet/ulostenaytteet/ulostenayte_f_baktvip_ja_f_ehecvtx_tutkimusta_varten/index.html). eNAT-putkeen laitettava oikea näytemäärä on tärkeää tutkimuksen onnistumisen kannalta.

Menetelmä

Nukleiinihapon osoitus PCR-tekniikalla, viljely erikoiselatusaineilla, tunnistaminen ja herkkyysmääritys viljelylöydöksistä.

Tekotiheys

ma-pe

Tulkinta

Normaalisti negatiivinen. Positiivisessa näytteessä nukleiinihaponosoituksella (löydös NhO+) ja viljelyllä todetut löydökset näkyvät erikseen.

Huomautuksia

Näytteet olisi saatava laboratorioon mieluiten vuorokauden kuluessa näytteenotosta. Yli kolme vuorokautta viipyneistä näytteistä negatiivinen tulos ei ole luotettava. Kuljetusta odotettaessa näytteitä säilytetään jääkaapissa.

Nukleiinihaponosoitus on viljelyä herkempi, joten sillä saatetaan löytää kantoja, joita ei saada viljeltyä eikä täten herkkyysmääritystä tehtyä.

Ripulia aiheuttavista E. coli -kannoista vain EHEC on mahdollista osoittaa viljelyllä. Nukleiinihaponosoituksella voidaan osoittaa myös muut ripulia aiheuttavat E. coli kannat (ETEC, EAEC, EIEC, EPEC.) EIEC on hyvin samankaltainen Shigellan kanssa, eikä sitä voida nukleiinihaponosoituksella erottaa Shigella-kannoista. ETEC kanta aiheuttaa vesiripulia, joka yleensä menee itsestään ohi muutamassa päivässä. EAEC ja EPEC kantojen rooli ripulin aiheuttamisessa on epäselvempi. Jos potilaalta löytyy EHEC, mahdollista samanaikaista EPEC-kannan läsnäoloa ei voida erikseen osoittaa.

Nukleiinihaponosoituksella voidaan osoittaa patogeeniset Yersiniat (Y.enterocolitica, Y .pseudotuberculosis ja Y.pestis). Näiden lajien erottelu tehdään viljelymenetelmällä. Nukleiinihaponosoitustesti ei tunnista muita ns. Y.enterocolitican kaltaisia lajeja tai matalavirulenttia Y.enterocolitica biotyyppiä 1A.

Positiivisen potilaan seurantatutkimukseksi suositellaan kyseistä viljelyllä tehtävää osatutkimusta (F -CampVi, F - SalmVi, F -ShigVi, F -YersVi). PCR-tutkimus ei ole juridisesti merkittävä esim. salmonella- kantajuuden osoittamisessa.

Tutkimus F -BaktVIP päivitetty 25.11.2019 / JA

Sivun alkuun

© HUSLAB-liikelaitos. Ohjekirjajärjestelmästä vastaa Janne Suvisaari.
Ohjekirjasivuston viimeisin automaattinen päivitys: 26.01.2020 klo 01:12.