HUS Diagnostiikkakeskus

Tutkimusohjekirjan etusivulle

RNA in situ hybridisaatiotutkimus kudosnäytteestä

23132 Ts-RNA-ISH

Tiedustelut

Meilahden patologian laboratorio, immunohistokemia 050 427 4880

Yhteyshenkilöt

lääkäri Jussi Tarkkanen: jussi.tarkkanenathus.fi / 050 427 1915, erikoistuva sairaalasolubiologi Reija Randen-Brady: reija.randen-bradyathus.fi / 050 427 2003 ja erikoistuva sairaalasolubiologi Noora Andersson: noora.anderssonathus.fi / 050 427 4897

Indikaatiot

Spesifin mRNA ekspression osoittaminen kudosnäytteestä.

Menetelmää käytetään transkriptionaalisessa vaiheessa olevan aktiivisen HPV-infektion tunnistamiseen kudosnäytteestä, jossa HPV:n onkogeeneille E6/E7 spesifinen koetin tunnistaa 18 kpl HPV:n korkeanriskin genotyyppiä (16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56,58, 59, 66, 68, 73 ja 82).

Näyte

Formaliiniin fiksoitu, parafiiniin pedattu histologinen kudosnäyte. Blokista leikataan neljä kappaletta 3-4µm:n paksuisia leikkeitä sähköisesti varatuille objektilaseille. Leikkeet ilmakuivataan, mutta niitä ei lämpökäsitellä ennen laboratorioon lähettämistä.

Patologi arvioi tutkimuksen tarpeellisuuden ja pyytää sen lisätutkimuksena.

Menetelmä

mRNA in situ hybridisaatio (mRNA ISH) on molekyylipatologinen menetelmä spesifisen mRNA:n osoittamiseksi formaliinifiksoidusta parafiiniin valetusta kudoksesta hybridisoimalla komplementaarinen nukleotidikoetin kohdesekvenssiin. mRNA ISH:ssa kaksois-z- oligonukleotidi koettimet sitoutuvat kohdesekvenssiin, johon signaalin vahvistuksen jälkeen liitetään kromogeeninen entsyymileima tulosten visualisointia varten.

Tekotiheys

kerran kuukaudessa tai sopimuksen mukaan

Tulkinta

Valomikroskoopissa mRNA transkriptit näkyvät erillisinä signaalipisteinä tai klustereina solujen tumissa ja sytoplasmassa. Testattavan kudosnäytteen lisäksi värjätään kolme kontrollinäytettä: RNAn laatua kontrolloiva PPIB-koetin ja epäspesifistä sitoutumista kontrolloiva DapB-koetin sekä tunnettu HR-HPV -positiivinen kudosnäyte. Patologi tai vastuuhenkilön valtuuttama sairaalalääkäri antaa lausunnon normaalikäytännön mukaisesti.

Tutkimus Ts-RNA-ISH päivitetty 27.08.2021 / AR

Sivun alkuun

Viimeisin päivitys: 28.10.2021 klo 02:24.