HUSLABin tutkimusohjekirjan on korvannut 15.10.2024 HUS Diagnostiikkakeskuksen "AMMATTILAISEN SIVUSTO".
Tälle sivulle osoittavat linkit pyydetään päivittämään osoittamaan uudelle sivustolle osoitteeseen
Tutkimuksen Ts-RNA-ISH (23132) tiedot vanhassa tutkimusohjekirjassa
HUOM! NÄMÄ TIEDOT EIVÄT OLE ENÄÄ AJAN TASALLA.
Meilahden patologian laboratorio, immunohistokemia 050 427 4880
Spesifin mRNA ekspression osoittaminen kudosnäytteestä.
Menetelmää käytetään transkriptionaalisessa vaiheessa olevan aktiivisen HPV-infektion tunnistamiseen kudosnäytteestä, jossa HPV:n onkogeeneille E6/E7 spesifinen koetin tunnistaa 18 kpl HPV:n korkeanriskin genotyyppiä (16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56,58, 59, 66, 68, 73 ja 82).
Formaliiniin fiksoitu, parafiiniin pedattu histologinen kudosnäyte. Blokista leikataan neljä kappaletta 3-4µm:n paksuisia leikkeitä sähköisesti varatuille objektilaseille. Leikkeet ilmakuivataan, mutta niitä ei lämpökäsitellä ennen laboratorioon lähettämistä.
Patologi arvioi tutkimuksen tarpeellisuuden ja pyytää sen lisätutkimuksena.
mRNA in situ hybridisaatio (mRNA ISH) on molekyylipatologinen menetelmä spesifisen mRNA:n osoittamiseksi formaliinifiksoidusta parafiiniin valetusta kudoksesta hybridisoimalla komplementaarinen nukleotidikoetin kohdesekvenssiin. mRNA ISH:ssa kaksois-z- oligonukleotidi koettimet sitoutuvat kohdesekvenssiin, johon signaalin vahvistuksen jälkeen liitetään kromogeeninen entsyymileima tulosten visualisointia varten.
kerran kuukaudessa tai sopimuksen mukaan
Valomikroskoopissa mRNA transkriptit näkyvät erillisinä signaalipisteinä tai klustereina solujen tumissa ja sytoplasmassa. Testattavan kudosnäytteen lisäksi värjätään kolme kontrollinäytettä: RNAn laatua kontrolloiva PPIB-koetin ja epäspesifistä sitoutumista kontrolloiva DapB-koetin sekä tunnettu HR-HPV -positiivinen kudosnäyte. Patologi tai vastuuhenkilön valtuuttama sairaalalääkäri antaa lausunnon normaalikäytännön mukaisesti.
