Orthopoxvirus, nukleiinihapon osoittaminen (kval)

4608

-PoxNhO

Tiedustelut

Virologian ja immunologian laboratorio, p. 040 659 2117

Yhteyshenkilöt

sairaalamikrobiologi Hannimari Kallio-Kokko: hannimari.kallio-kokkohus.fi / 050 427 0476, sairaalamikrobiologi Laura Mannonen: laura.mannonenhus.fi / 040 838 4009 ja lääkäri Satu Kurkela: satu.kurkelahus.fi / 050 428 4183

Indikaatiot

Kliininen epäily orthopoxvirusinfektiosta (esim. lehmärokko). Infektiohälytystilanteet (apinarokkoepäily tai isorokkoepäily). Parapoxvirusinfektiota epäiltäessä (esim. ORF-virusten aiheuttama infektio ihmisellä) tilataan lisäksi pyyntö -ZoonNhO, 20857.

Näyteastia

Katso kohta "Näyte" (Weblab Clinicalissa "Näytteen käs.ohjeet")

Näyte

Rikotun rakkulan pohjalta tai leesiosta otetaan näyte steriilillä dacron- tai nailontikulla viruskuljetusputkeen (3 ml Copan UTM) tai vaihtoehtoisesti tehdaspuhtaaseen, kierrekorkilliseen muoviputkeen, jossa n. 1-1,5 ml steriiliä keittosuolaliuosta. Kudospala (muutaman kuutiomillimetrin pala) laitetaan kierrekorkilliseen muoviputkeen pieneen määrään steriiliä fysiologista keittosuolaliuosta tai viruskuljetusputkeen. Kudospalan voi toimittaa myös steriiliin fysiologiseen keittosuolaan kostutetussa sideharsotaitoksessa, joka on suljettu tehdaspuhtaaseen kierrekorkilliseen muoviseen näyteastiaan.

Menetelmä

Nukleiinihapon osoitus PCR-tekniikalla. Orthopoxvirusten tai parapoxvirusten tarkempi tyypitys tehdään tarvittaessa sekvenoinnin avulla. Apinarokkovirukselle käytössä spesifi PCR-testi.

Tekotiheys

Tarpeen mukaan

Tulokset valmiina

Katso tutkimus 15392 -PoxPAK.

Tulkinta

Poxvirus-DNA:n löytyminen näytteestä suoraan on diagnostinen löydös.

Huomautuksia

Huom. tutkimusta tilattaessa on aina jo ennen näytteenottoa otettava yhteys HUS DGK:n virologian ja immunologian laboratorioon. Yhteydenotot virka-aikaan p. 040 659 2117, virka-ajan ulkopuolella päivystävä laboratoriohoitaja p. 040 837 4010 tai 040 837 4011.

Apinarokkoepäilynäytteet voidaan lähettää kategoria B -kuljetuksena, isorokkoepäilynäytteet vaativat kategoria A -kuljetuksen. Infektiohälytysnäytteitä sisältävien pakettien päälle kirjataan selkeästi merkintä "Infektiohälytys - POX-epäily".

Parapoxvirusinfektiota (esim. ORF-virus) epäiltäessä tilataan -PoxNhO-tutkimuksen lisäksi myös -ZoonNhO-tutkimus (20857).

Tutkimus -PoxNhO päivitetty 21.08.2024 / AJ

Sivun alkuun

Viimeisin päivitys: 20.09.2024 klo 00:41.