HUSLAB - tutkimusohjekirja

Tutkimuksen Ts-MELAS-D (4665) tiedot vanhassa tutkimusohjekirjassa

HUOM! NÄMÄ TIEDOT EIVÄT OLE ENÄÄ AJAN TASALLA.

Tiedustelut

Genetiikan laboratorio, puh. 09 471 74339 toimisto tai 09 471 75905 lääkäri tai Genetiikanlaboratorio(at)hus.fi

Lähete

Geneettiset tutkimukset

Indikaatiot

MELAS-taudin, hypertrofisten kardiomyopatioiden, kuurouden ja diabeteksen diagnostiikka ja erotusdiagnostiikka.

Näyteastia

Eppendorf-putki

Näyte

Lihasnäyte otetaan kuivaan mikrosentrifugiputkeen (Eppendorf-putki tai vastaava) ja tuodaan välittömästi jäissä Genetiikan laboratorioon. Mikäli näytettä ei voida tuoda välittömästi, on näyte pakastettava mahdollisimman nopeasti (nopea syväjäädytys) ja pakattava hiilihappojäihin styrox-laatikkoon. Näyte ei saa sulaa kuljetuksen aikana. Näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB-talo, Näytteiden vastaanotto, Topeliuksenkatu 32, Tunnus 5000493, Info MNVO, 00006 VASTAUSLÄHETYS. Kiireelliset näytteet pyydetään merkitsemään paketin ulko- ja sisäpuolelle merkinnällä "Kiireellinen".

Menetelmä

NGS (next generation sequencing, massiivinen rinnakkaissekvensointi).

Tulokset valmiina

8 viikon kuluessa näytteen saapumisesta.

Yleistä

Mitokondriossa on oma 16,6 kb:n kokoinen DNA, joka koodittaa 13 valkuaista ja niiden synteesiin tarvittavat ribosomi- ja siirtäjä-RNAt. Nämä valkuaiset ovat hengitysketjuentsyymien alayksiköitä komplekseissa I, III, IV ja V. Mitokondrioiden DNA periytyy äidin munasoluissa kaikille lapsille.

MELAS-oireyhtymässä (mitokondriaalinen enkefalopatia, laktaattiasidoosi, kohtausmaiset "stroke-like" episodit) on 80 %:ssa tapauksia kuvattu mitokondrio-DNAn leusiini-tRNAn pistemutaatio A>G nukleotidissä 3243 (m.3243A>G). MELAS-oireyhtymän lisäksi m.3243A>G-mutaatio voi liittyä mm. etenevään silmälihasheikkouteen ja yleistyneeseen lihasheikkouteen, mitokondriaaliseen diabetes-kuurous oireyhtymään (MIDD, mitochondrial diabetes and deafness), sekä aikuis- tai juveniilialkuiseen hypertrofiseen kardiomyopatiaan. Taudin alkuikä vaihtelee varhaislapsuudesta varttuneeseen aikuisuuteen. Yleensä veren laktaatti on koholla, ja lihasbiopsian histologisessa tutkimuksessa nähdään sytokromi-c-oksidaasi negatiivisia syitä.

Tutkimuksessa analysoidaan yleisimmän m.3243A>G-mutaation (n. 80 % potilaista, käytetään myös nimeä A3243G) lisäksi seuraavat harvinaisemmat MELAS-oireyhtymää aiheuttavat mutaatiot: m.3271T>C (<10 % MELAS-potilaista, T3271C), m.3252A>G (<5 % MELAS-potilaista, A3252G), m.13513G>A (G13513A), sekä m.4332G>A (G4332A).

Tulkinta

Mikäli näytteessä todetaan jokin tutkituista MELAS-oireyhtymää aiheuttavista mutaatioista heteroplasmisena (normaalin mtDNAn rinnalla), löydös on diagnostinen mitokondriotaudille. Yleensä mutantin mtDNA:n prosentuaalinen määrä korreloi osittain taudin vaikeusasteeseen, ja on kudoksessa tyypillisesti yli 30% kokonais-mtDNA:sta oireisilla potilailla.

Huomautuksia

Positiivisen tuloksen jälkeen suositellaan potilaalle ja hänen sukulaisilleen perinnöllisyysneuvontaa, koska mutaatio periytyy maternaalisesti. Mikäli löydös jää negatiiviseksi ja histologinen tutkimus viittaa mitokondriotautiin, kannattaa harkita mtDNA:n läpisekvensointia (22065 Ts-NGSmMT2) tai mitokondriotauteja aiheuttavien tuman geenien tutkimusta (22066 B -NGSgMT3) tai molempia (22069 Ts-NGSpMT1).

Kiireellisestä tutkimuksesta (tulos kahden viikon sisällä) on ilmoitettava etukäteen laboratorioon ja kiireellisyys on merkittävä selvästi lähetteeseen. Tutkimuksesta peritään kiireellisyyslisä eikä jatkotutkimuksia tehdä kiireellisinä ilman erillistä pyyntöä.