HUSLAB - tutkimusohjekirja
HUSLABin tutkimusohjekirjan on korvannut 15.10.2024 HUS Diagnostiikkakeskuksen "AMMATTILAISEN SIVUSTO".
Tutkimus Ts-NARP-D (4667) NARP-oireyhtymä, mitokondriaalisen DNA:n valtamutaation tutkimus kudosnäytteestä uudella sivustolla
Tälle sivulle osoittavat linkit pyydetään päivittämään osoittamaan uudelle sivustolle osoitteeseen
https://diagnostiikka.hus.fi/tutkimus?id=4667
Tutkimuksen Ts-NARP-D (4667) tiedot vanhassa tutkimusohjekirjassa
HUOM! NÄMÄ TIEDOT EIVÄT OLE ENÄÄ AJAN TASALLA.
Tiedustelut
Genetiikan laboratorio, puh. 09 471 74339 toimisto tai 09 471 75905 lääkäri tai Genetiikanlaboratorio(at)hus.fi
Lähete
Indikaatiot
NARP-taudin diagnostiikka, Leigh'n taudin diagnostiikka, sensoristen neuropatioiden erotusdiagnostiikka, ataksioiden erotusdiagnostiikka.
Näyteastia
Eppendorf-putki
Näyte
Lihasnäyte otetaan kuivaan mikrosentrifugiputkeen (Eppendorf-putki tai vastaava) ja tuodaan välittömästi jäissä Genetiikan laboratorioon. Mikäli näytettä ei voida tuoda välittömästi, on näyte pakastettava mahdollisimman nopeasti (nopea syväjäädytys) ja pakattava hiilihappojäihin styrox-laatikkoon. Näyte ei saa sulaa kuljetuksen aikana. Näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB-talo, Näytteiden vastaanotto, Topeliuksenkatu 32, Tunnus 5000493, Info MNVO, 00006 VASTAUSLÄHETYS.
Menetelmä
NGS (next generation sequencing, massiivinen rinnakkaissekvensointi).
Tulokset valmiina
8 viikon kuluessa näytteen saapumisesta.
Yleistä
Mitokondriossa on oma 16,6 kb:n kokoinen DNA, joka koodittaa 13 valkuaista ja niiden synteesiin tarvittavat ribosomi- ja siirtäjä-RNAt. Nämä valkuaiset ovat hengitysketjuentsyymien alayksiköitä komplekseissa I, III, IV ja V. Mitokondrioiden DNA periytyy äidin munasoluissa kaikille lapsille. NARP-oireyhtymän (neurogeeninen lihasheikkous, ataksia, retinitis pigmentosa, kouristukset, dementia, kehitysviivästymä ja / tai sensorinen neuropatia) ja joskus Leigh'n oireyhtymän taustalla on kuvattu diagnostinen mitokondrio-DNA:n pistemutaatio T>G tai T>C ATP synteesin 6. alayksikön geenin nukleotidissa 8993 (m.8993T>G tai m.8993T>C). Mutaatioiden määrä korreloi hyvin taudin vaikeusasteeseen, ja vakavin ilmiasu, Leigh'n oireyhtymä, vaatii yli 90 % mtDNA:sta olevan mutatoitunutta.
Tulkinta
Jos näytteessä todetaan m.8993T>G tai m.8993T>C mutaatio, se on diagnostinen NARP-oireyhtymälle tai mitokondriaaliselle Leigh'n taudille.
Huomautuksia
Positiivisen tuloksen jälkeen suositellaan potilaalle ja hänen sukulaisilleen perinnöllisyysneuvontaa, koska mutaatio periytyy maternaalisesti. Mikäli löydös jää negatiiviseksi ja oireisto sopii mitokondriotautiin, kannattaa harkita mtDNA:n läpisekvensointia (22065 Ts-NGSmMT2) tai MIRAS-taudin diagnostiikkaa (kts. 20035 B -POLG-D) tai mitokondriotauteja aiheuttavien tuman geenien tutkimusta (22066 B -NGSgMT3). NARP mutaatio-DNA:n osuus on veressä lähellä samaa kuin lihaksessa. Siksi verinäytteestä tehtävän NARP-mutaatioanalyysin tulos on luotettava, eikä tähän analyysiin tarvita lihaskoepalaa. NARP-mutaatio ei aiheuta lihaskoepalaan mitokondriaalisia poikkeavuuksia.
Kiireellisestä tutkimuksesta (tulos kahden viikon sisällä) on ilmoitettava etukäteen laboratorioon ja kiireellisyys on merkittävä selvästi lähetteeseen. Tutkimuksesta peritään kiireellisyyslisä eikä jatkotutkimuksia tehdä kiireellisinä ilman erillistä pyyntöä.