T-solureseptorin gammaketjun geenin uudelleenjärjestymä, kvantitatiivinen jäännöstautianalyysi, luuytimestä

6185

Bm-TCRG-D

Tiedustelut

Genetiikan laboratorio 050 427 1237 ja 050 4280992

Yhteyshenkilöt

sairaalageneetikko Reetta Vainionpää: reetta.vainionpaahus.fi / 050 427 1237 ja sairaalageneetikko Elina Kaikkonen: elina.kaikkonenhus.fi / 050 4280992

Lähete

Geneettinen tutkimus, maligniteetit

Indikaatiot

Hematologisten maligniteettien (leukemiat, lymfoomat) diagnoosivaihe ja seurantatutkimukset.

Suoritus

Näytteestä eristetystä genomisesta DNA:sta monistetaan kohdealueet multiplex-PCR-menetelmällä ja kohdealueiden emäsjärjestys määritetään Ion Torrent -puolijohdesekvensoinnilla. Uudelleenjärjestymien tunnistamiseen ja tulosten tulkintaan käytetään LymphoTrack Dx -ohjelmaa.

Näyteastia

EDTA-putki 5/3 ml

Näyte

3-5 ml luuydinaspiraattia EDTA-putkessa. Tarvittaessa näytettä voi säilyttää max. 5 vrk jääkaapissa. Putkea ei saa pakastaa. Meilahden alueella otettu näyte lähetetään välittömästi Genetiikan laboratorioon (putkipostiasema HUSLAB-talon moniajoasema 6300). Meilahden ulkopuolelta tuleva näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB-talo, Näytteiden vastaanotto, Topeliuksenkatu 32, Tunnus 5000493, Info MNVO, 00006 VASTAUSLÄHETYS. Kiireelliset näytteet pyydetään merkitsemään paketin ulko- ja sisäpuolelle merkinnällä "Kiireellinen".

Menetelmä

NGS (next generation sequencing)

Tekotiheys

Viikoittain

Tulokset valmiina

2-3 viikon kuluessa

Yleistä

T-solureseptorin uudelleenjärjestymätutkimuksen avulla voidaan todeta T-solureseptorin gammaketjun geenin (TRG) klonaaliset uudelleenjärjestymät. Tutkimus tehdään kaupallisella LymphoTrack Dx TRG -kitillä, jolla voidaan tutkia TRG-geenin varioivaa osaa V- ja J-geenisegmenttien konservoituneille alueille sitoutuvilla alukkeilla.

Tulkinta

Positiivinen tulos viittaa T-solureseptorin gammaketjun geenin klonaaliseen uudelleenjärjestymään ja mahdolliseen maligniteettiin. Poikkeavuutta voidaan käyttää potilaan taudin molekyyligeneettisessä seurannassa.

Tutkimus Bm-TCRG-D päivitetty 16.04.2024 / RV

Sivun alkuun

Viimeisin päivitys: 18.04.2024 klo 00:41.