T-solureseptorin gammaketjun geenin uudelleenjärjestymä, kudosnäytteestä

6186

Ts-TCRG-D

Tiedustelut

Genetiikan laboratorio 050 427 1237 ja 050 4280992

Yhteyshenkilöt

sairaalageneetikko Reetta Vainionpää: reetta.vainionpaahus.fi / 050 427 1237 ja sairaalageneetikko Elina Kaikkonen: elina.kaikkonenhus.fi / 050 4280992

Lähete

Geneettinen tutkimus, maligniteetit

Indikaatiot

Lymfaattisten maligniteettien diagnoosivaihe ja seurantatutkimukset.

Suoritus

Näytteestä eristetystä genomisesta DNA:sta monistetaan kohdealueet multiplex-PCR-menetelmällä ja kohdealueiden emäsjärjestys määritetään Ion Torrent -puolijohdesekvensoinnilla. Uudelleenjärjestymien tunnistamiseen ja tulosten tulkintaan käytetään LymphoTrack Dx -ohjelmaa.

Näyte

Kudospala ravintonesteessä tai suolaliuoksessa. Toissijaisesti parafiinileikkeet tai parafiiniblokki ja HE-lasi. Lähettävän laboratorion patologi valitsee kudosblokista edustavan kohdan ja merkitsee arvion kasvainsolujen määrästä lähetteeseen. Näytteeksi tarvitaan 4-6 kpl 10 mikrometrin paksuista parafiinileikettä pieneen muovipurkkiin (esim. formaliinipurkkiin). Meilahden alueella otettu näyte lähetetään välittömästi Genetiikan laboratorioon (putkipostiasema HUSLAB-talon moniajoasema 6300). Meilahden ulkopuolelta tuleva näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB-talo, Näytteiden vastaanotto, Topeliuksenkatu 32, Tunnus 5000493, Info MNVO, 01006 VASTAUSLÄHETYS. Kiireelliset näytteet pyydetään merkitsemään paketin ulko- ja sisäpuolelle merkinnällä "Kiireellinen".

Menetelmä

NGS (next generation sequencing)

Tekotiheys

Viikoittain

Tulokset valmiina

2-3 viikon kuluessa

Yleistä

T-solureseptorin uudelleenjärjestymätutkimuksen avulla voidaan todeta T-solureseptorin gammaketjun geenin (TRG) klonaaliset uudelleenjärjestymät. Tutkimus tehdään kaupallisella LymphoTrack Dx TRG -kitillä, jolla voidaan tutkia TRG-geenin varioivaa osaa V- ja J-geenisegmenttien konservoituneille alueille sitoutuvilla alukkeilla.

Tulkinta

Positiivinen tulos viittaa T-solureseptorin gammaketjun geenin klonaaliseen uudelleenjärjestymään ja mahdolliseen maligniteettiin. Poikkeavuutta voidaan käyttää potilaan taudin molekyyligeneettisessä seurannassa.

Tutkimus Ts-TCRG-D päivitetty 16.04.2024 / RV

Sivun alkuun

Viimeisin päivitys: 07.09.2024 klo 00:40.