T-solureseptorin gammaketjun geenin uudelleenjärjestymä, kudosnäytteestä
| 6186 | Ts-TCRG-D |
Tiedustelut
Genetiikan laboratorio 050 427 1237 ja 050 427 9125
Yhteyshenkilöt
sairaalageneetikko Reetta Vainionpää: reetta.vainionpaa
hus.fi / 050 427 1237 ja sairaalageneetikko Soili Kytölä: soili.kytolahus.fi / 050 427 9125
Lähete
Geneettinen tutkimus, maligniteetit
Indikaatiot
Lymfaattisten maligniteettien diagnoosivaihe ja seurantatutkimukset.
Suoritus
Näytteestä eristetystä genomisesta DNA:sta monistetaan kohdealueet multiplex-PCR-menetelmällä ja kohdealueiden emäsjärjestys määritetään Ion Torrent -puolijohdesekvensoinnilla. Uudelleenjärjestymien tunnistamiseen ja tulosten tulkintaan käytetään LymphoTrack Dx -ohjelmaa.
Näyte
Kudospala ravintonesteessä tai suolaliuoksessa. Toissijaisesti parafiinileikkeet tai parafiiniblokki ja HE-lasi. Lähettävän laboratorion patologi valitsee kudosblokista edustavan kohdan ja merkitsee arvion kasvainsolujen määrästä lähetteeseen. Näytteeksi tarvitaan 4-6 kpl 10 mikrometrin paksuista parafiinileikettä pieneen muovipurkkiin (esim. formaliinipurkkiin). Meilahden alueella otettu näyte lähetetään välittömästi Genetiikan laboratorioon (putkipostiasema HUSLAB-talon moniajoasema 6300). Meilahden ulkopuolelta tuleva näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB-talo, Näytteiden vastaanotto, Topeliuksenkatu 32, Tunnus 5000493, Info MNVO, 01006 VASTAUSLÄHETYS. Kiireelliset näytteet pyydetään merkitsemään paketin ulko- ja sisäpuolelle merkinnällä "Kiireellinen".
Menetelmä
NGS (next generation sequencing)
Tekotiheys
Viikoittain
Tulokset valmiina
2-3 viikon kuluessa
Yleistä
T-solureseptorin uudelleenjärjestymätutkimuksen avulla voidaan todeta T-solureseptorin gammaketjun geenin (TRG) klonaaliset uudelleenjärjestymät. Tutkimus tehdään kaupallisella LymphoTrack Dx TRG -kitillä, jolla voidaan tutkia TRG-geenin varioivaa osaa V- ja J-geenisegmenttien konservoituneille alueille sitoutuvilla alukkeilla.
Tulkinta
Positiivinen tulos viittaa T-solureseptorin gammaketjun geenin klonaaliseen uudelleenjärjestymään ja mahdolliseen maligniteettiin. Poikkeavuutta voidaan käyttää potilaan taudin molekyyligeneettisessä seurannassa.
Tutkimus Ts-TCRG-D päivitetty 01.03.2022 / SK
Viimeisin päivitys: 05.12.2023 klo 00:41.