Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan
Vertaileva genominen hybridisaatio -mikrolevytesti, luuytimestä
| 8261 | Bm-VGH-ML |
Tiedustelut
Genetiikan laboratorio 050 4286393 ja 050 4286912
Yhteyshenkilöt
sairaalageneetikko Tarja Salonen: tarja.salonen
hus.fi / 0504286393 ja sairaalageneetikko Anne Juvonen: anne.juvonenhus.fi / 0504286912
Lähete
Indikaatiot
Tutkimusta käytetään kromosomitutkimuksia täydentävänä tutkimuksena hematologisissa maligniteeteissa.
Suoritus
DNA-eristys, DNA:n leimaaminen ja hybridisoiminen kaupalliselle 180 000 oligonukleotidin mikrosirulle (OGT Cancer+SNP 180k array). Geenien kopiomäärän lukeminen laserskannerilla ja analysointi tietokoneohjelmalla.
Näyteastia
EDTA-putki
Näyte
3-5 ml luuydinaspiraattia EDTA-putkessa. Näytteen säilytys ensisijaisesti huoneenlämmössä (1-5 vrk). Pidempiaikainen säilytys jääkaapissa. Näytteen mukaan liitetään lähete "Lähete geneettistä maligniteetteihin liittyvää tutkimusta varten", jonka saa HUSLABin nettisivuilta osoitteesta http://huslab.fi/ohjekirjan_liitteet/lahetteet. Lähetys: Meilahden alueella otettu näyte lähetetään välittömästi Genetiikan laboratorioon (putkipostiasema HUSLAB-talon moniajoasema 6300). Meilahden ulkopuolelta tuleva näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB-talo, Näytteiden vastaanotto, Topeliuksenkatu 32, Tunnus 5000493, Info MNVO, 00006 VASTAUSLÄHETYS. Kiireelliset näytteet pyydetään merkitsemään paketin ulko- ja sisäpuolelle merkinnällä "Kiireellinen".
Menetelmä
Molekyylikaryotyypitys (aCHG). Akkreditoitu menetelmä.
Akkreditoitu testauslaboratorio T055
Tekotiheys
Joka toinen viikko.
Tulokset valmiina
Kuukauden kuluessa
Tulkinta
Tutkimuksen avulla voidaan osoittaa DNA:n kopiomäärän suhteellisia muutoksia (esim. kromosomien tai kromosomialueiden monosomiat ja trisomiat, deleetiot ja duplikaatiot, sekä korkea-asteiset monistumat) jopa yksittäisen geenin tarkkuudella. Tutkimuksessa käytetyn sirun resoluutio on koko genomin laajuisesti n.50-200kb. Lisäksi tunnetuissa maligniteetteihin liittyvissä geeneissä on kohdennettu resoluutio, joka kattaa osan geeneistä jopa eksonin tarkkuudella. Menetelmällä ei voida havaita balansoituneita kromosomien ja geenien uudelleenjärjestymiä eikä vain pienessä osassa soluja esiintyviä DNA:n kopiomäärän muutoksia. Tutkimuksesta annetaan kirjallinen lausunto.
Huomautuksia
Tutkimusta kutsutaan myös molekyylikaryotyypitykseksi tai CGH-array-tutkimukseksi.
Tutkimus Bm-VGH-ML päivitetty 08.11.2017 / AJ
© HUSLAB-liikelaitos. Ohjekirjajärjestelmästä vastaa Janne Suvisaari.
Ohjekirjasivuston viimeisin automaattinen päivitys: 24.01.2020 klo 12:39.